Efektivitas Deteksi Escherichia coli Berbasis PCR dari Sampel Urin Pagi Pasien Infeksi Saluran Kemih

Infeksi saluran kemih (ISK) merupakan salah satu infeksi bakteri yang banyak ditemukan
pada pelayanan kesehatan. Escherichia coli merupakan salah satu uropatogen yang paling sering
dikaitkan dengan ISK. Pemeriksaan kultur urine masih menjadi pemeriksaan rujukan, tetapi
prosesnya membutuhkan waktu lebih lama dibandingkan pemeriksaan molekuler. Polymerase
Chain Reaction (PCR) dapat digunakan untuk mendeteksi materi genetik bakteri secara lebih cepat
dan spesifik.
Penelitian ini disusun untuk mengidentifikasi DNA Escherichia coli dari sampel urine pagi
pasien ISK menggunakan teknik PCR. Rancangan yang digunakan adalah deskriptif laboratorik
dengan pendekatan cross sectional. Sampel urine pagi diperiksa melalui tahap ekstraksi DNA,
amplifikasi PCR, dan visualisasi produk amplifikasi menggunakan elektroforesis gel agarosa.
Hasil positif ditentukan berdasarkan terbentuknya pita DNA pada posisi fragmen target.
Untuk kepentingan penyusunan contoh laporan ini, angka hasil pemeriksaan dan gambar
elektroforesis pada BAB V merupakan DATA SIMULASI, bukan data pasien atau hasil
pemeriksaan laboratorium yang sebenarnya. Data tersebut dibuat agar format laporan dapat
ditampilkan secara utuh dan tidak boleh digunakan sebagai pengganti data penelitian primer.
Pada data simulasi sebanyak 12 sampel, delapan sampel menunjukkan pita DNA target dan
empat sampel tidak menunjukkan pita target, sehingga diperoleh hasil positif sebesar 66,7% dan
negatif sebesar 33,3%. Temuan simulasi ini hanya digunakan untuk memperlihatkan cara
penyajian hasil dan pembahasan, bukan sebagai kesimpulan penelitian aktual.
Kata kunci: Escherichia coli; infeksi saluran kemih; urine pagi; DNA; Polymerase Chain
Reaction; PCR.